Association loi 1901, le Conseil National des Villes et Villages Fleuris est chargé d'organiser et de promouvoir le concours des Villes et Villages Fleuris.

Son Conseil d'Administration est composé de représentants du secteur public (ministères, collectivités locales, organismes publics) et de représentants des secteurs professionnels du tourisme, de l'horticulture et du paysage. L'Unep y est représentée en tant que personnalité qualifiée du collège 5.